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POLIMORFISMOS DE MARCADORES ASOCIADOS A LA CALIDAD DE LECHE EN POBLACIONES CRIOLLAS Y TRANSFRONTERIZAS

Villalobos-Cortés, Axel; Castillo, Hilda; Murillo, Manuel; González-Herrera, Rita

POLYMORPHISMS OF MARKERS ASSOCIATED WITH MILK QUALITY IN CREOLE AND CROSS-BORDER POPULATIONS




Autores Villalobos-Cortés, Axel
Autores Castillo, Hilda
Autores Murillo, Manuel
Autores González-Herrera, Rita

Descripción Genetic breeding programs have gradually changed from traditional phenotypic selection methods to quantitative and genotypic selection using molecular markers and the identification of genes related to economically important traits. The objective of this work was to identify six single nucleotide polymorphisms associated (SNP) with milk quality genes, DGAT1, CSN1S1, CSN1S2, LALBA, GH1 and ABCG2 in some creole and cross-border populations breeds by sequencing (NGS). Random samples were taken from 73 animals of various pure genotypes, Creoles (Guaymi, GUY and Guabala, GUA), Cross-border breeds (Brahman, BRAH; Holstein, HO; Senepol, SEN; Guaymi, GUY and Guabala, GUA) and cross genotypes (European x Zebu, EXC and Indefinite, SRD). SNP analysis was performed using the Truseq Bovine Parentage sequencing panel. To calculate the genetic variability within population, the following parameters were calculated: Hardy-Weinberg equilibrium, Allelic and genotypic frequency, observed heterozygosis (Hob) and expected (He) and Shannon Index. The markers GH1, LALBA and ABCG2 were monomorphic. The most informative markers were DGAT1, CSN1S1 and CSN1S2, with the DGAT1 marker having the highest Hob and He values with values of 0,424 and 0,430, respectively, and the lowest values for Hob and He were observed in CSN1S2 with 0,247 and 0,276, respectively. These results suggest that the polymorphic markers found may be useful in breeding programs, adding to the quantitative selection, however, further analysis is required, increasing the number of animals and breeds. It was possible to determine polymorphisms in the markers DGAT1, CSN1S1 and CSN1S2, in the genotypes submitted to the present study, however, no alleles fixed in the Holstein and Guabala breeds were observed. The Guabala breed showed a fixation of the A allele in ABCG2, a completely opposite situation in the rest of the genotypes studied.
Descripción Los programas de mejoramiento genético de ganado han cambiado gradualmente de métodos tradicionales de selección fenotípica a la selección cuantitativa y genotípica mediante la utilización de marcadores moleculares y la identificación de genes relacionados a rasgos económicamente importantes. El objetivo de este trabajo fue identificar seis polimorfismos de nucleótido simple asociados (SNP) a genes de calidad de leche, DGAT1, CSN1S1, CSN1S2, LALBA, GH1 y ABCG2 en algunas poblaciones criollas y transfronterizas mediante secuenciación NGS. Se tomaron muestras aleatorias de 73 animales de diversos genotipos puros, Criollos (Guaymí, GUY y Guabalá, GUA) transfronterizos (Brahman, BRAH; Holstein, HO y Senepol, SEN) y cruzados (europeo x cebú, EXC e Indefinidos, SRD). El análisis de los SNP se realizó mediante el panel de secuenciación Truseq Bovine Parentage. Para calcular la variabilidad genética dentro de cada población, se calcularon los siguientes parámetros: Equilibrio Hardy-Weinberg, Frecuencia alélica y genotípica, heterocigosis observada (Hob) y esperada (He) e Índice de Shannon. Los marcadores GH1, LALBA y ABCG2 resultaron monomórficos. Los marcadores más informativos fueron DGAT1, CSN1S1 y CSN1S2, siendo el marcador DGAT1 el que presentó mayores valores de Hob y He con valores de 0,424 y 0,430, respectivamente, y los valores más bajos para Hob y He se observaron en CSN1S2 con 0,247 y 0,276, respectivamente. Estos resultados apuntan que los marcadores polimórficos encontrados pueden ser de utilidad en los programas de mejoramiento sumando a la selección cuantitativa, sin embargo, se requiere un mayor análisis, incrementando el número de animales y razas. Se logró determinar polimorfismos en los marcadores DGAT1, CSN1S1 y CSN1S2, en los genotipos sometidos al presente estudio, sin embargo, no se observaron alelos fijados en las razas Holstein y Guabalá. La raza Guabalá mostró una fijación del alelo A en ABCG2, situación totalmente contraria en el resto de los genotipos estudiados.

Editorial Instituto de Innovación Agropecuaria de Panamá

Fecha 2021-07-01

Tipo info:eu-repo/semantics/article
Tipo info:eu-repo/semantics/publishedVersion
Tipo Artículo revisado por pares

Formato application/pdf

Identificador http://www.revistacienciaagropecuaria.ac.pa/index.php/ciencia-agropecuaria/article/view/487

Fuente Ciencia Agropecuaria; Núm. 33 (2021): CIENCIA AGROPECUARIA; 32-43
Fuente 2414-3278
Fuente 0258-6452

Idioma spa

Relación http://www.revistacienciaagropecuaria.ac.pa/index.php/ciencia-agropecuaria/article/view/487/389